Havørnens stemme er karakteristisk og høres ofte ved reden:
- *Gøende "klick-klick-klick" eller "kli-kli-kli-kli" — høje, hårde og rytmiske tonerækker. - Latterkald ved reden: et gentaget "klä-klä-klä", der minder om en stor måge. - Tiggelyd fra ungerne:* et klynkende "psii-psii".
Havørnen høres sjældent uden for yngletiden. Optagelser findes på xeno-canto.