Lille flagspætte hakker selv sin rede ud og er afhængig af morkent ved, hvor den kan mejsle.
- *Redehul: et eget, lille hul, der hakkes ud i en morken stamme eller gren af et løvtræ, hvor veddet er tilstrækkeligt blødt. - Afhængig af dødt ved: behovet for morkne løvtræer og stående dødt ved gør arten følsom over for det moderne skovbrug. - Forældrepleje:* hunnen lægger som regel 5–6 æg, og begge forældre deltager i rugning og fodring af ungerne.
Mængden af gamle løvtræer og dødt ved afgør derfor, hvor arten kan yngle, hvilket bidrager til, at den går tilbage.