- Markmus og mus (60–70 % af kosten) — hovedføden, deraf navnet; søges visuelt fra luften. - Frøer, firben og slanger. - Fugleunger og kaniner — opportunistisk. - Regnorme — søges på våde marker, usædvanligt for en rovfugl. - Ådsler — vigtigt i kolde vintre.
Musvågen lokaliserer bytte visuelt ved at spejde fra en siddeplads eller i svæveflugt. UV-syn til at spore urin fra markmus er dokumenteret hos tårnfalk (Falco tinnunculus), ikke hos musvåge.