Grønsiskenen yngler gerne højt oppe i nåletræer, ofte i toppen af en gran. Reden er en lille, velskjult skål af kviste, laver og fjer. Hunnen lægger som regel 4–5 æg, som hun ruger i cirka to uger. Arten kan yngle i løse kolonier og tilpasser til en vis grad ynglen efter granens frøproduktion.