Høgeuglen yngler i hulrum, gerne i en naturlig træhule, i toppen af en knækket, mør stub eller i en kasse. Hunnen lægger et kuld på oftest 5–9 æg, og kuldstørrelsen styres stærkt af gnaverudbuddet. Gode museår giver store kuld og høj ungeproduktion, mens dårlige år kan føre til, at ynglen helt udebliver. Høgeuglen forsvarer reden kraftfuldt mod ubudne gæster.