Spætmejsen yngler i huller — gamle spættehuller, naturlige træhuller eller kasser. Er redeåbningen for stor, murer fuglen den til med ler, indtil hullet passer, hvilket beskytter mod større konkurrenter og rovdyr. Hunnen lægger som regel 6-9 æg, som hun ruger i cirka to uger. Begge forældre fodrer ungerne, som forlader reden efter godt tre uger. Spætmejsen er stærkt territorial, og et par holder ofte samme område hele livet.